Κάποια έμβρυα με χρωμοσωμικές ανωμαλίες παρουσιάζουν ορισμένα ευρήματα στον υπέρηχο που ονομάζονται ‘’soft markers’’. Αυτά συμπεριλαμβάνουν την πάχυνση της αυχενικής πτυχής (nuchal fold), την απουσία ή υποπλασία του ρινικού οστού, αυξημένη ποσότητα υγρού στις πλάγιες κοιλίες του εγκεφάλου, ηχογενείς εστίες μέσα στην καρδία, ήπια υδρονέφρωνση, κοντά άκρα, υπερηχογενές έντερο και αποκλίνουσα δεξιά υποκλείδια αρτηρία.
Τα πιο πάνω χαρακτηριστικά μπορεί να εμφανίζονται και σε φυσιολογικά έμβρυο γιαυτό και η οριστική διάγνωση γίνεται με την αμνιοπαρακέντηση όταν υπάρχει ένδειξη.